现在，医药公司使用的财务软件主要分为两类：传统的财务软件以及现代的财务自动化软件。

传统的财务软件通常是桌面应用程序，可以帮助使用者完成许多财务任务，如资产管理、税收管理、财务报表制作和财务报告等。传统的财务软件一般具有完善的功能，但使用不够方便，而且容易出现新增模块或报表制作时耗时的问题。

现代医药公司可以选择的财务自动化软件包括Access Dimensions、NetSuite ERP和 Sage Intacct等。这些自动化财务软件可以根据医药公司的不同要求提供专门的模块，如费用记录模块、供应商和客户管理模块以及财务报表生成模块。这些软件可以有效地管理企业财务流程，提高企业的财务效率，提供企业财务报表，以便医药公司可以更快更容易地对财务状况进行评估。

总之，传统的财务软件适用于小型和中型医药公司，而现代财务自动化软件则可以满足大型医药公司的财务需求，使医药公司可以有效地管理财务流程。

拓展知识：随着新技术的发展，还有一种新颖的财务管理软件在市场上出现，即由财务云服务提供商（Financial Cloud Service Provider, FCC）提供的云服务（Cloud Service）。FCC位于互联网中，可以从远程位置提供服务，使公司可以在电脑上访问，从而更轻松地进行财务管理，可以更快地了解财务状况，进行智能分析，以便更有效地管理财务。相比传统的财务软件，FCC具有更好的安全性，更易用的界面，更高的性能，更低的成本，可以更快地完成财务任务，帮助公司更高效地管理财务流程。